Corso di Laurea in Tecniche di Laboratorio Biomedico - Cuneo

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE. Alla fine dell’insegnamento studenti e studentesse dovranno:

• Aver acquisito le conoscenze relative alla patogenesi delle principali malattie infettive e alla profilassi e ai principi di terapia delle malattie ad eziologia batterica, funginea, parassitaria e virale;
• Aver acquisito le principali nozioni di parassitosi umane con riferimenti di epidemiologia;
• Conoscere le basi di virologia generale e speciale, con particolare riguardo alle diagnosi di laboratorio;
• Aver appreso i differenti principi strumentali utilizzati all’interno dei laboratori di microbiologia ad elevata automazione.

CONOSCENZA E CAPACITA' DI COMPRENSIONE APPLICATE. Al termine dell'insegnamento, studenti e studentesse dovranno:

• Applicare le conoscenze acquisite per poter formulare un'ipotesi di avvenuta infezione microbica e per istruire terzi sulla prevenzione da adottare per evitare la trasmissione delle infezioni.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO. Al termine dell'insegnamento, studenti e studentesse dovranno:

• Essere in grado di scegliere un metodo diagnostico diretto adeguato per l’analisi microbiologia di una infezione ad eziologia microbica;
• Sapere riconoscere quale possano essere le misure di prevenzione adeguate per evitare la trasmissione dell’infezione;
• Sapere individuare l’approccio terapeutico adatto al trattamento dell’infezione;
• Sapere scegliere lo strumento diagnostico adatto all’identificazione e alla valutazione del profilo di sensibilità o resistenza agli antibiotici;
• Mantenersi aggiornati sulla materia mediante consultazione di fonti e banche dati accreditate che trattino della specifica materia e che riportino casi di infezione recenti e dati epidemiologici.

ABILITA' COMUNICATIVE. Al termine dell’insegnamento studenti e studentesse dovranno essere in grado di utilizzare un linguaggio scientifico rigoroso su temi in ambito microbiologico, sia nella forma scritta che orale, unitamente all'utilizzo e alla discussione di schemi grafici e immagini per rappresentare i modelli descrittivi della materia.

CAPACITA' DI APPRENDIMENTO. Alla fine dell’insegnamento studenti e studentesse avranno maturato un metodo di studio adeguato e un pensiero critico della materia, attraverso l'utilizzo del materiale fornito a lezione, integrato con altre risorse (libri di testo e risorse on-line, precedentemente discusse con il Docente). 

Microbiologia Speciale:

Batteri Gram-positivi: Genere Staphylococcus: S. aureus e S. epidermidis; Genere Streptococcus: S. pneumoniae, S. pyogenes; Corynebacterium spp (C. diphteriae); Listeria monocytogenes; Genere Bacillus (B. anthracis, B. cereus); Genere Clostridium (C. tetani, C. botulinum, C. perfringens, C. difficile); Lattobacilli.

Batteri Gram-negativi: Enterobacteriaceae (E. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Salmonella spp., Shigella spp,.Yersinia spp.); Vibrioni (Vibrio cholerae); Pseudomonas aeruginosa; Neisserie spp (N. gonorrhoeae, N. meningitidis); Haemophilus spp. (H. influenzae); Bordetella spp. (B. pertussis), Brucella spp, Legionella spp., Campylobacter spp., Helicobacter pylori.

Spirochete: Generi Treponema, Borrelia e Leptospira

Clamidie: C. trachomatis, C. psittaci, C. Pneumoniae

Micobatteri: M. Tuberculosis, M. Leprae

Mycoplasma pneumoniae, Ureaplasma spp

Cenni di micologia speciale: micosi cutanee (Dermatofiti), Aspergillosi, Candidosi

Virologia generale e speciale

• Caratteristiche generali dei virus (struttura, morfologia, classificazione)
• Replicazione virale
• Patogenesi virale
• Immunità intrinseca, innata e adattativa
• Vaccini
• Diagnostica virologica.
• Patogenesi, manifestazioni cliniche, diagnostic virologica delle infezioni causate da:

• virus a DNA (Poxvìridae. Herpesviridae. Adenoviridae, Polyomaviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae, Hepadnaviridae, Parvoviridae)
• virus a RNA (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Rhahdoviridae, Retroviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Filoviridae, Bunyaviridae)

Parassitologia e malattie infettive

-Parassitologia generale: definizione di parassita e ospite, parassitosi ed adattamento trofico, fisiologico e morfologico; generalità sui cicli di vita dei parassiti; contatto e penetrazione nell'ospite; specificità parassitaria; interazione parassita-ospite e azione patogena dei parassiti.

- Epidemiologia, Ciclo Biologico, Morfologia di:

*Protozoi: amebe, flagellati, ciliati, coccidi, sporozoi

*Elminti:       Platelminti (Cestodi, Trematodi)

                    Nematodi

*Artropodi

-Metodi di Laboratorio: indagine anamnestica, esame macroscopico, esame microscopico, diagnosi immunologica, ricerca di protozoi, di elminti, tecniche di colorazione, tecniche di concentrazione, esame colturale. Accenni di terapia farmacologica.

Scienze tecniche: microbiologia diagnostica

• Funzione del laboratorio di microbiologia
• Caratteristiche del rapporto ospite-parassita :esempi di colonizzazione, adesione, invasione e disseminazione.
• Sangue :  batteriemia,  sepsi (SIRS), sepsi severa, shock settico. Ruolo dell’emocolture, brodi di coltura e dosaggio PCT.
• Strumenti per emocolture: differenti principi analitici delle  apparecchiature attualmente in commercio ( sistemi : fluorimetrico, colorimetrico, radiometrico, impedenziometrico).
• Indagini microbiologiche su punte di catetere.
• Identificazioni batteriche attraverso i sistemi “Multipli”(tipo API) e lettore per sistemi a “galleria”.
• Enterotube.
• Cenni alla tecnica di semina : isolamento miceti e batteri.
• Ruolo del laboratorio di microbiologia nelle indagini per Fibrosi Cistica.
• Antibiogramma manuale :   Kirby-Bauer
• ETEST
• Presentazione dei concetti base dell’utilizzo dei valori soglia Breakpoint, valori di ECOFF,
• Wilde Type secondo sistema EUCAST ( interpretazione ATB).
• Infezioni nosocomiali : principali localizzazioni delle infezioni e microrganismi responsabili (iter diagnostico dalla raccolta alla refertazione del campione).
• Sistemi ad Automazione variabile e completa : esempi di strumentazione attualmente in uso e funzioni di ciascun modulo
• Principi di lettura in automazione : fotometria-fluorimetria.
• Esempi di antibiogramma ed antimicogramma secondo i sistemi automatizzati.
• Letture di MIC turbidimetrica nelle diverse apparecchiature.
• Funzione dei software “dedicati” a strumenti ad automazione completa.
• Test automatizzati per la diagnosi rapida delle batteriurie.
• Spettrometria di massa: procedimento, Target plate, disgregazione, ionizzazione, desorbimento campione. 

Special Microbiology:

Gram-positive bacteria: Staphylococcus, Streptococcus, Corynebacterium, Listeria monocytogenes, Bacillus, Clostridium, Lactobacillus.

Gram-negative bacteria: Enterobacteriaceae (E. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Salmonella spp., Shigella spp,.Yersinia spp.); Vibrions (Vibrio cholerae); Pseudomonas aeruginosa; Neisserie spp (N. gonorrhoeae, N. meningitidis); Haemophilus spp. (H. influenzae); Bordetella spp. (B. pertussis), Brucella spp, Legionella spp., Campylobacter spp., Helicobacter pylori; Spirochetales; Chlamydia;

Mycobacteria; Mycoplasmas and Ureaplasmas.

Hints of special mycology: skin mycoses (Dermatophytes), Aspergillosis, Candidiasis

Virology:

• General properties of viruses (structure, morphology, classification)
• Viral replication
• Viral pathogenesis
• Intrinsic, innate, and adaptative defenses
• Diagnostic virology
• Vaccines
• Pathogenesis, clinical signs and virological diagnosis of the infections caused by:

• DNA viruses (Poxvìridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Polyomaviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae, Hepadnaviridae, Parvoviridae)
• RNA viruses (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Rhahdoviridae, Retroviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Filoviridae, Bunyaviridae)

Parasitology and infectious diseases

- General parasitology: definition of parasite and host, parasitosis and trophic, physiological 
and morphological adaptation; general information on the life cycles of parasites; contact and
 penetration into the host; parasitic specificity; parasite-host interaction and pathogenic action 
of parasites.

- Epidemiology, Biological Cycle, Morphology of:

* Protozoa: amoebae, flagellates, ciliates, coccidia, sporozoa

* Helminths:  Platyhelminthes (Cestoda, Trematoda)

            Nematoda

*Arthropods

-Laboratory Methods: anamnestic investigation, macroscopic examination, microscopic 
examination, immunological diagnosis, research of protozoa, helminths, staining techniques, 
concentration techniques, culture examination.
Hints of drug therapy.

DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY

- Function of the microbiology laboratory
- Characteristics of the host-parasite relationship: examples of colonization, adhesion, invasion, and dissemination.
- Blood : bacteremia, sepsis (SIRS ), severe sepsis, septic shock . Role of blood culture, culture broths and PCT dosage.
- Blood culture tools: different analytical principles of the equipment currently on the market .
- Microbiological investigations of catheter tips.
- Bacterial identification using the "Multiples" (type API ) system  and "gallery" systems reader.
- Enterotube.
- Technique of sowing: the isolation of fungi and bacteria.
- Role of the microbiology lab in the investigation for Cystic Fibrosis.
- Manual antibiogram: Kirby -Bauer
- ETEST
- Presentation of the conceptsabout the use of the threshold Breakpoint values, ECOFF values, the        Wilde Type according to EUCAST (ATB interpretation).
- Nosocomial infections : main localization of infections and causative organisms (diagnostic process from collection to publication of the results) .
- Systems of variable and complete automation: examples of instrumentation currently in use and functions of each module.
- Principles of fluorescence - photometric - radiometric reading.
- Examples of antibiogram and antifungal sensibility test according to automated systems.
- MIC turbidimetric readings in different equipment .
- Function of software "dedicated" to complete automation tools.
- Automated testing for the rapid diagnosis of bacteriuria
-Mass spectrometry: procedure- MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption/ionization-time of fligt mass spectrometry)

L’insegnamento consiste di 4 moduli, così ripartiti:

Microbiologia Speciale – 24 ore di lezione, 2 CFU

Virologia Generale e Speciale – 36 ore di lezione, 3 CFU

Parassitologia e Malattie infettive – 12 ore di lezione, 1 CFU

Scienze Tecniche: Microbiologia Diagnostica – 24 ore di lezione, 2 CFU

Le lezioni verrano svolte in presenza o eccezionalmente, a causa dell'emergenza Coronavirus, a distanza via Webex, oppure in regime misto qualora subentrino problematiche che non consentano la lezione in presenza.

Microbiologia speciale. L’esame consiste in una prova orale, valutata in trentesimi, in cui verranno poste due/tre domande sulla parte di batteriologia speciale.

Virologia. L’esame consiste in una prova orale, valutata in trentesimi, in cui verranno poste una domanda sulla parte di virologia generale e due domande sulla parte di virologia speciale (una su virus a DNA e una su virus a RNA).

Parassitologia e malattie infettive: l'esame consiste in una prova scritta a scelta multipla.

Scienze Tecniche, Microbiologia Diagnostica: l'esame consiste in una prova scritta a scelta multipla.

Il voto finale del corso integrato sarà dato dalla somma delle medie pesate dei quattro moduli, basandosi sui CFU di ciascuna. L'esame viene considerato superato con votazione ≥18/30 in ognuno dei moduli

Non sono presenti attività opzionali ma i docenti ed i collaboratori alla didattica del corso integrato sono disponibili per rispondere ai quesiti degli studenti al di fuori dell’orario delle lezioni, previo appuntamento.

Microbiologia Speciale e Virologia:

Brock. Biologia dei microrganismi. Microbiologia generale, ambientale e industriale. Pearson

Lembo, Donalisio, Landolfo. Microbiologia per le professioni sanitarie. EdiSES

La Placa. Principi di Microbiologia Medica. Ed. Esculapio Medicina

Murray. Microbiologia medica, Ed. Edra

Parassitologia e malattie infettive:

Ivo De Carneri: parassitologia generale e umana Casa editrice ambrosiana Milano

Scienze Tecniche, microbiologia diagnostica:

“Medicina di laboratorio—Principi di tecnologia Microhiologia Clinica” di A. Burlina

“Diagnostica e Tecniche di laboratorio” (Batteriologia) di F. Pasquinelli

“Microbiologia clinica” di Roberto Cevenini-PICCIN-seconda edizione 2010

“Atlante di Microbiologia Diagnostica”—Elmer W.Koneman— Delfino editore— seconda edizione

Il materiale didattico delle lezioni è reperibile sulla piattaforma Moodle, ai link disponibili nei singoli moduli.