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I. MICROBIOLOGIA SPECIALE E TECNICHE DIAGNOSTICHE

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MICROBIOLOGY AND DIAGNOSTIC TECHNIQUES

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Anno accademico 2017/2018

Codice dell'attività didattica
MED2885
Docenti
Dott. Valentina DELL'OSTE (Docente Responsabile del Corso Integrato)
Dott. Pietro Luigi GARAVELLI (Docente Titolare dell'insegnamento)
Gianni PELLEGRINO (Docente Titolare dell'insegnamento)
Corso di studi
[f070-c711] TECNICHE DI LABORATORIO BIOMEDICO (ABILITANTE ALLA PROFESSIONE SANITARIA DI TECNICO DI LABORATORIO BIOMEDICO)
Anno
3° anno
Tipologia
--- Nuovo Ordinamento ---
Crediti/Valenza
8
SSD dell'attività didattica
MED/07 - microbiologia e microbiologia clinica
MED/46 - scienze tecniche di medicina e di laboratorio
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Obbligatoria
Tipologia d'esame
Scritto ed orale
Prerequisiti
Italiano
Al fine di poter affrontare i contenuti previsti dall’insegnamento integrato, si ritiene necessario. come previsto dalle regole di propedeuticità per l’accesso al 3° anno di corso, l’acquisizione delle conoscenze relative ai corsi di base del 1° e 2° anno
English
To learn the contents of the complete course basic knowledge acquired from courses of the fìrst and second year is required.
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

Al termine del corso gli studenti avranno acquisito le conoscenze relative alla patogenesi delle principali malattie infettive con il relativo approfondimento delle caratteristiche morfologiche e di virulenza dei più importanti microrganismi patogeni (batteri, miceti, virus e parassiti). Gli studenti avranno infine acquisito conoscenze sulla diagnosi di laboratorio (manuale ed automatizzata), sulla profilassi e sui principi di terapia delle malattie ad eziologia batterica, fungina, virale e parassitaria.

At the end of the course, students will acquire competences about the epidemiology and pathogenesis of the major infectious diseases, and the virulence characteristics of the most important pathogens (bacteria, fungi, viruses and parasites). Finally, students will acquire knowledge about laboratory diagnosis, prophylaxis and treatment of bacterial, fungal, viral and parasitic diseases.

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Risultati dell'apprendimento attesi

Lo studente dovrà:

Lo studente dovrà aver acquisito le conoscenze relative alla patogenesi delle principali malattie infettive e alla profilassi e i principi di terapia delle malattie ad eziologia batterica e fungina. In particolare, lo studente dovrà dimostrare: di aver acquisito le principali nozioni di parassitosi umane con riferimenti di epidemiologia; di conoscere le basi di virologia, con particolare riguardo alle diagnosi di laboratorio; di aver appreso i differenti principi strumentali utilizzati all’interno dei laboratori di microbiologia ad elevata automazione.

Students will achieve specific competences about the pathogenesis of the major infectious diseases; prophylaxis and treatment of the bacterial and fungal infections; parasitic diseases and epidemiology; viruses and related diseases in particular about laboratory diagnosis; principles of the main laboratory techniques used in microbiology labs with high automation.

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Modalità di insegnamento

L’insegnamento consiste di 4 moduli, così ripartiti:

Microbiologia Speciale – 24 ore, 2 CFU

Virologia Generale e Speciale – 36 ore, 3 CFU

Parassitologia e Malattie infettive – 12 ore, 1 CFU

Scienze Tecniche: Microbiologia Diagnostica – 24 ore, 2 CFU

Le lezioni dell’insegnamento si articolano in 96 ore totali di didattica frontale, che si svolgono in aula con l’ausilio di proiezioni.

 

The course is divided in:

Special microbiology – 24 hours, 2 credits

General and Medical Virology – 36 hours, 3 credits

Parasitology and infectious diseases – 12 hours, 1 credit

Diagnostic microbiology – 24 hours, 2 credits

Total: 96 hours; lessons are supported by slides and videos.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

Microbiologia speciale. L’esame consiste in una prova orale, valutata in trentesimi, in cui verranno poste due domande sulla parte di batteriologia speciale ed una domanda sulla parte ai miceti.

Virologia. L’esame consiste in una prova orale, valutata in trentesimi, in cui verranno poste una domanda sulla parte di virologia generale e due domande sulla parte di virologia speciale (una su virus a DNA e una su virus a RNA).

Parassitologia e malattie infettive: l'esame consiste in una prova orale, basata su tre domande di cui due sull'impiego di test diagnostici specifici per alcune malattie infettive batteriche, virali e protozoarie ed una sui principali esami indiretti che si impiegano in diagnostica infettivologica con valore non specifico, ma orientativo.

Scienze Tecniche, Microbiologia Diagnostica: l'esame consiste in una prova orale, basata su tre domande relative all'impiego di test diagnostici specifici impiegati nei laboratori di microbiologia.

Il voto finale del corso integrato sarà dato dalla somma delle medie pesate dei quattro moduli, basandosi sui CFU di ciascuna. L'esame viene considerato superato con votazione ≥18/30 in ognuno dei moduli

Special microbiology. At the end of the course, the final grade will be determined by an oral examination. The exam consists of 2 questions about bacterial infections, whereas one question will be based on fungal infection.

Virology. At the end of the course, the final grade will be determined by an oral examination. This exam consists of 2 questions about the program of general virology, whereas one question will be based on specific virus families (one about DNA viruses, one RNA viruses).

Parassitology and infectious diseases. The final grade is determined by an oral examination, based on three questions: two questions will be about specific diagnostic tests for infectious diseases, whereas one question will be about the main indirect tests used in microbiology.

Technical sciences, diagnostic microbiology. The final grade is determined by an oral examination, based on three questions about specific tests applied in laboratories of microbiology.

Examination is passed by the student with a minimum grade of 18/30 in the four disciplines

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Attività di supporto

Non sono presenti attività opzionali ma i docenti ed i collaboratori alla didattica del corso integrato sono disponibili per rispondere ai quesiti degli studenti al di fuori dell’orario delle lezioni, previo appuntamento.

Optional activities are not scheduled for this course. Teachers and collaborators are available for students by appointment

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Programma

Microbiologia Speciale:

Batteri Gram-positivi: Genere Staphylococcus: S. aureus e S. epidermidis; Genere Streptococcus: S. pneumoniae, S. pyogenes; Corynebacterium spp (C. diphteriae); Listeria monocytogenes; Genere Bacillus (B. anthracis, B. cereus); Genere Clostridium (C. tetani, C. botulinum, C. perfringens, C. difficile); Lattobacilli.

Batteri Gram-negativi: Enterobacteriaceae (E. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Salmonella spp., Shigella spp,.Yersinia spp.); Vibrioni (Vibrio cholerae); Pseudomonas aeruginosa; Neisserie spp (N. gonorrhoeae, N. meningitidis); Haemophilus spp. (H. influenzae); Bordetella spp. (B. pertussis), Brucella spp, Legionella spp., Campylobacter spp., Helicobacter pylori.

Spirochete: Generi Treponema, Borrelia e Leptospira

Clamidie: C. trachomatis, C. psittaci, C. Pneumoniae

Micobatteri: M. Tuberculosis, M. Leprae

Mycoplasma pneumoniae, Ureaplasma spp

Virologia generale e speciale

  • Caratteristiche generali dei virus (struttura, morfologia, classificazione)
  • Replicazione virale
  • Patogenesi virale
  • Immunità intrinseca, innata e adattativa
  • Vaccini
  • Diagnostica virologica.
  • Patogenesi, manifestazioni cliniche, diagnostic virologica delle infezioni causate da:
  • virus a DNA (Poxvìridae. Herpesviridae. Adenoviridae, Polyomaviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae, Hepadnaviridae, Parvoviridae)
  • virus a RNA (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Rhahdoviridae, Retroviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Filoviridae, Bunyaviridae)

Parassitologia e malattie infettive

Parassitologia Generale/Parassitologia Speciale: Epidemiologia, Ciclo Biologico, Morfologia e Tecniche Diagnostiche di:

Protozoi: amebe, flagellati, ciliati, coccidi, sporozoi

Entamoeba hystolitica/dispar, Entamoeba coli, Iodamoeba butschlii, Endolimax nana, Naegleria, Acanthamoeba, Blastocystis hominis, Giardia lamblia, Balantidium coli, Isospora belli, Cyclosposa cayetanensis, cryptosporidium parvum, microsporidi, Trichomonas vaginalis, Toxoplasma gondii, Plasmodi (falciparum, vivax, ovale, malariae), Babesia,  Leishmanie,(donovani, infamtum, tropica), Tripanosomi (gambiense, rhodesiense, cruzi)

ELMINTI:       PLATELMINTI CESTODI  Taenai saginata, Taenia solium, (Teniosi, Cisticercosi)  Diphillobotrium latum, Echinococcus granulosus, Hymenolepis nana, Hymenolopis diminuta

PLATELMINTI TREMATODI Schistosoma mansoni, Schistosoma japonicum, Schistosoma haematobium Fasciola epatica, Fasciolopsis buski, Clonorchis sinensis, Paragonimus westermani

NEMATODI Ascaris lumbricoides Trichuris trichiura, Enterobius vermicularis Trichinella spiralis, Strongyloides stercoralis, Ancylostoma duodenalis / Necator americanus, Toxocara canis, Wucherereria bancrofti Brugia malaii Loa loa Mansonella ozzardi Onchocerca volvulus, Dracunculus medinensis, Dirofilaria

ARTROPODI

Pidocchi Pediculus humanus capitis, corporis, Phthirus pubis

Pulci, Zecche: Argasidae, Ixodidae Sarcoptes scabiaei, Demodex folliculorum, Dermanyssus gallinae

Scienze tecniche: microbiologia diagnostica

  • Funzione del laboratorio di microbiologia
  • Caratteristiche del rapporto ospite-parassita :esempi di colonizzazione, adesione, invasione e disseminazione.
  • Sangue :  batteriemia,  sepsi (SIRS), sepsi severa, shock settico. Ruolo dell’emocolture, brodi di coltura e dosaggio PCT.
  • Strumenti per emocolture: differenti principi analitici delle  apparecchiature attualmente in commercio ( sistemi : fluorimetrico, colorimetrico, radiometrico, impedenziometrico).
  • Indagini microbiologiche su punte di catetere.
  • Identificazioni batteriche attraverso i sistemi “Multipli”(tipo API) e lettore per sistemi a “galleria”.
  • Enterotube.
  • Cenni alla tecnica di semina : isolamento miceti e batteri.
  • Ruolo del laboratorio di microbiologia nelle indagini per Fibrosi Cistica.
  • Antibiogramma manuale :   Kirby-Bauer
  • ETEST
  • Presentazione dei concetti base dell’utilizzo dei valori soglia Breakpoint, valori di ECOFF,
  • Wilde Type secondo sistema EUCAST ( interpretazione ATB).
  • Infezioni nosocomiali : principali localizzazioni delle infezioni e microrganismi responsabili (iter diagnostico dalla raccolta alla refertazione del campione).
  • Sistemi ad Automazione variabile e completa : esempi di strumentazione attualmente in uso e funzioni di ciascun modulo
  • Principi di lettura in automazione : fotometria-fluorimetria.
  • Esempi di antibiogramma ed antimicogramma secondo i sistemi automatizzati.
  • Letture di MIC turbidimetrica nelle diverse apparecchiature.
  • Funzione dei software “dedicati” a strumenti ad automazione completa.
  • Test automatizzati per la diagnosi rapida delle batteriurie.
  • Spettrometria di massa: procedimento, Target plate, disgregazione, ionizzazione, desorbimento campione.

Special Microbiology:

Gram-positive bacteria: Staphylococcus, Streptococcus, Corynebacterium, Listeria monocytogenes, Bacillus, Clostridium, Lactobacillus. Gram-negative bacteria: Enterobacteriaceae (E. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Salmonella spp., Shigella spp,.Yersinia spp.); Vibrions (Vibrio cholerae); Pseudomonas aeruginosa; Neisserie spp (N. gonorrhoeae, N. meningitidis); Haemophilus spp. (H. influenzae); Bordetella spp. (B. pertussis), Brucella spp, Legionella spp., Campylobacter spp., Helicobacter pylori; Spirochetales; Chlamydia; Mycobacteria; Mycoplasmas and Ureaplasmas.

Virology:

  • General properties of viruses (structure, morphology, classification)
  • Viral replication
  • Viral pathogenesis
  • Intrinsic, innate, and adaptative defenses
  • Diagnostic virology
  • Vaccines
  • Pathogenesis, clinical signs and virological diagnosis of the infections caused by:
  • DNA viruses (Poxvìridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Polyomaviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae, Hepadnaviridae, Parvoviridae)
  • RNA viruses (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Rhahdoviridae, Retroviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Filoviridae, Bunyaviridae)

PARASITOLOGY AND INFECTIUOS DISEASES: general parasitology, special parasitology: epidemiology, life cycle,  morphology and diagnostic methods. protozoa:  amoeba, flagellati, ciliati, coccidi, sporozoa: Entamoeba hystolitica/dispar, Entamoeba coli, Iodamoeba butschlii, Endolimax nana, Naegleria, Acanthamoeba, Blastocystis hominis, Giardia lamblia, Balantidium coli, Isospora belli, Cyclosposa cayetanensis, cryptosporidium parvum, microsporidi, Trichomonas vaginalis, Toxoplasma gondii, Plasmodi (falciparum, vivax, ovale, malariae), Babesia,  Leishmanie,(donovani, infamtum, tropica), Tripanosomi (gambiense, rhodesiense, cruzi). Helminths:    plathelminthes cestoidean: Taenia saginata, Taenia solium, (Teniosi, Cisticercosi)  Diphillobotrium latum, Echinococcus granulosus, Hymenolepis nana, Hymenolopis diminuta. Plathelminthes trematoda Schistosoma mansoni, Schistosoma japonicum, Schistosoma haematobium Fasciola epatica, Fasciolopsis buski, Clonorchis sinensis, Paragonimus westermani.  Nematoda: Ascaris lumbricoides Trichuris trichiura, Enterobius vermicularis Trichinella spiralis, Strongyloides stercoralis, Ancylostoma duodenalis / Necator americanus, Toxocara canis, Wucherereria bancrofti Brugia malaii Loa loa Mansonella ozzardi Onchocerca volvulus, Dracunculus medinensis, Dirofilaria. Arthropods: Pediculus humanus capitis, corporis, Phthirus pubis. Pulex. Ticks: Argasidae, Ixodidae Sarcoptes scabiaei, Demodex folliculorum, Dermanyssus gallinae

DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY

- Function of the microbiology laboratory
- Characteristics of the host-parasite relationship: examples of colonization, adhesion, invasion, and dissemination.
- Blood : bacteremia, sepsis (SIRS ), severe sepsis, septic shock . Role of blood culture, culture broths and PCT dosage.
- Blood culture tools: different analytical principles of the equipment currently on the market .
- Microbiological investigations of catheter tips.
- Bacterial identification using the "Multiples" (type API ) system  and "gallery" systems reader.
- Enterotube.
- Technique of sowing: the isolation of fungi and bacteria.
- Role of the microbiology lab in the investigation for Cystic Fibrosis.
- Manual antibiogram: Kirby -Bauer
- ETEST
- Presentation of the conceptsabout the use of the threshold Breakpoint values, ECOFF values, the        Wilde Type according to EUCAST (ATB interpretation).
- Nosocomial infections : main localization of infections and causative organisms (diagnostic process from collection to publication of the results) .
- Systems of variable and complete automation: examples of instrumentation currently in use and functions of each module.
- Principles of fluorescence - photometric - radiometric reading.
- Examples of antibiogram and antifungal sensibility test according to automated systems.
- MIC turbidimetric readings in different equipment .
- Function of software "dedicated" to complete automation tools.
- Automated testing for the rapid diagnosis of bacteriuria
-Mass spectrometry : procedure- MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption/ionization-time of fligt mass spectrometry)

Testi consigliati e bibliografia

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Microbiologia Speciale e Virologia:

Brock, Biologia dei Microrganismi, Casa Editrice Ambrosiana

Lembo - Donalisio – Landolfo, Microbiologia per le professioni sanitarie, EdiSES

La Placa, Principi di Microbiologia Medica, Ed. Esculapio Medicina

Parassitologia e malattie infettive:

Ivo De Carneri: parassitologia generale e umana Casa editrice ambrosiana Milano

Scienze Tecniche, microbiologia diagnostica:

“Medicina di laboratorio—Principi di tecnologia Microhiologia Clinica” di A. Burlina

“Diagnostica e Tecniche di laboratorio” (Batteriologia) di F. Pasquinelli

“Microbiologia clinica” di Roberto Cevenini-PICCIN-seconda edizione 2010

“Atlante di Microbiologia Diagnostica”—Elmer W.Koneman— Delfino editore— seconda edizione

Special microbiology and Virology:

Brock, Biologia dei Microrganismi, Casa Editrice Ambrosiana

Lembo - Donalisio – Landolfo, Microbiologia per le professioni sanitarie, EdiSES

La Placa, Principi di Microbiologia Medica, Ed. Esculapio Medicina

Parasitology and infectious diseases:

Ivo De Carneri: parassitologia generale e umana Casa editrice ambrosiana Milano

Diagnostic Microbiology:

“Medicina di laboratorio—Principi di tecnologia Microhiologia Clinica” di A. Burlina

“Diagnostica e Tecniche di laboratorio” (Batteriologia) di F.Pasquinelli

“Microbiologia clinica” di Roberto Cevenini-PICCIN-seconda edizione 2010

“Atlante di Microbiologia Diagnostica”—Elmer W.Koneman— Delfino editore— seconda edizione



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Moduli didattici

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Ultimo aggiornamento: 28/06/2017 15:42
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